Use este identificador para citar ou linkar para este item: https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/447
Tipo: Dissertação
Título: Ancoragem de genomas incompletos em genomas completos
Autor(es): Lima, André Chastel
Abstract: Um projeto genoma usual possui três etapas. A primeira, denominada, sequenciamento e montagem, consiste na determinação da sequência exata de todos os seus cromossomos. A segunda, conhecida como anotação, consiste na descoberta da posição exata dos genes de cada cromossomo, quais as proteínas produzidas por eles e qual a função de cada uma delas. Ao final, a análise do genoma consiste na descoberta de funcionalidades específicas ou comuns a outros organismos. Algumas vezes não se deseja terminar completamente a primeira fase. Nesses casos tem-se, ao invés de cromossomos, apenas trechos contíguos e disjuntos dos cromossomos, chamados de contigs. Mesmo assim, ainda é possível chegar as conclusões importantes acerca das funcionalidades do organismo estudado. Este trabalho consiste no estudo de algumas ferramentas de comparação de sequências, visando usá-las como instrumento para mapear os contigs de um genoma incompleto no genoma completo de um organismo evolutivamente próximo. Dessa forma, é possível auxiliar proetos cujo objetivo seja apenas entender mecanismos biológicos importantes do organismo, sem que haja a necessidade de completar seu genoma.
An usual genome project three steps. The first one, called sequencing an assembling, consists en determining the exact sentence of each chromosome. The second one, called annotation, consists in finding out the exact position of all chromosome genes, the proteins they produce and what the function of these proteins. The third step aims the analysis of the genome by determining its specific and common functionalities. Sometimes the first step is not completed. In these cases, instead of a set of chromosomes, one has only a set of contiguous and disjoint pieces, called contigs. Nevertheless, it is still possible draw conclusions about the organism functionalities. This work consists of a study of some sequence comparison tool, aiming using them as a mapping tool of contigs of an incomplete genome onto a close related complete genome. In this way it is possible to help projects in wich the goal is just understanding important biological features without finishing the whole genome.
Palavras-chave: Genoma
Biologia Molecular
Bioinformática
Tipo de Acesso: Acesso Aberto
URI: https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/447
Data do documento: 2007
Aparece nas coleções:Programa de Pós-graduação em Ciência da Computação

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