Remontagem de Genomas: uma Avaliação das Técnicas de novo e por Comparação

Abstract

As técnicas de sequenciamento de nova geração são alternativas ao método Sanger de sequenciamento. Essas técnicas produzem um grande volume de reads por ciclo de execução. Muitas vezes, esses reads precisam ser remontados seguindo alguma técnica de remontagem a m de se obter um genoma completo. Abordamos neste trabalho as técnicas de remontagem de novo e remontagem por comparação, avaliando os resultados produzidos por ambas. Como a anotação de um genoma e um processo que depende da remontagem do genoma, deve ser criteriosa a escolha de uma ferramenta para tal m.

The Next-Generation Sequencing techniques are an approach for reads assembly and differs from Sanger method. Those techniques produces a big amount of reads per execution. In many occasions, those reads must be assembled to form a whole genome. We give an approach about Comparative-Assembling and de novo Assembling in this project. Besides, we compare the results from both assembly techniques. Its important to follow some rules on choosing a software to assembly reads, giving the important of this step to determine a whole genome.