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Tipo: Dissertação
Título: Classificação de Sequências Metagenômicas
Autor(es): Asseiss Neto, Habib
Abstract: Este trabalho discute alguns m etodos para o problema de classi ca c~ao de sequ^encias metagen^omicas, e apresenta um m etodo alternativo baseado em compara c~ao de sequ^encias, montagem de fragmentos e logenia, cuja principal caracter stica e a de agrupar apenas sequ^encias que compartilham similaridade com prote nas conhecidas. O m etodo proposto foi testado com um conjunto de dados metagen^omicos simulados e apresentou resultados satisfat orios, quando comparado com outros. Al em de se mostrar util como m etodo direto de classi ca c~ao, pode tamb em ser utilizado como auxiliar, corrigindo classi ca c~oes erradas feitas por outras metodologias.
This work presents a discussion of some methods to the problem of classifying metagenomic sequences, and presents an alternative method based on sequence comparison, fragment assembly and phylogeny, whose the main feature is the grouping of only sequences that share similarity to known proteins. The method has been tested on a simulated set of metagenomic sequences and has shown satisfying results when compared to others. Besides proven useful as a direct method of classi cation, it can also be used as auxiliary one, correcting erroneous classi cations made by other methodologies.
Palavras-chave: Bioinformática
Bioinformatics
Biologia Molecular - processamento de dados
Molecular Biology - data processing
Genética Molecular - processamento de dados
Molecular Genetics - data processing
Engenharia Genética
Genetic Engineering
Genômica
Genomics
Tipo de Acesso: Acesso Aberto
URI: https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/1647
Data do documento: 2012
Aparece nas coleções:Programa de Pós-graduação em Ciência da Computação

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