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https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/11044
Tipo: | Dissertação |
Título: | Efeitos das mutações E484A, E484K e E484Q na proteína Spike do SARSCoV-2: Um estudo in silico |
Autor(es): | JÉSSICA DE MORAES CARRETONE |
Primeiro orientador: | Marcos Serrou do Amaral |
Resumo: | A COVID-19, causada pelo vírus SARS-CoV-2 se tornou uma pandemia em março de 2020 e desde então tem causado inúmeros prejuízos, tanto materiais quanto em vidas. Como todos os vírus de RNA, possui alta capacidade de mutação, principalmente na proteína Spike. O objetivo é analisar os efeitos das mutações E484A, E484K e E484Q, em comparação com a estrutura nativa, através de Dinâmica Molecular. Os dados de RMSD e RMSF mostraram que a variante E484K foi a que obteve maior variação entre todas as variantes e a nativa. As variantes E484A e E484Q mostraram comportamento semelhante à nativa. A região do laço que se liga ao receptor ACE-2 mostrou menores valores de RMSD e RMSF em todas as variantes e a nativa. Palavras-chave: SARS-CoV-2, COVID-19, Spike |
Abstract: | COVID-19, caused by the SARS-CoV-2 virus, became a pandemic in March 2020 and since then has caused numerous damages, both material, and lives. Like all RNA viruses, it has a high capacity for mutation, mainly in the Spike protein. The objective is to analyze the effects of mutations E484A, E484K and E484Q, in comparison with the native structure, through Molecular Dynamics. The RMSD and RMSF data showed that the E484K variant had the greatest variation between all variants and the native one. The E484A and E484Q variants showed similar behavior to the native one. The loop region that binds to the ACE-2 receptor showed lower values of RMSD and RMSF in all variants and the native one. |
Palavras-chave: | SARS-CoV-2, COVID-19, Spike |
País: | Brasil |
Editor: | Fundação Universidade Federal de Mato Grosso do Sul |
Sigla da Instituição: | UFMS |
Tipo de acesso: | Acesso Aberto |
URI: | https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/11044 |
Data do documento: | 2022 |
Aparece nas coleções: | Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Materiais |
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