Análise de nutrientes utilizando redes metabólicas

Abstract

Neste trabalho apresentamos uma introdução sobre as redes metabólicas de organismos, seus principais conceitos biológicos, as possíveis formas de modelagem destas redes em estruturas de dados, uma formalização matemática de três dos principais problemas relacionados à análise de nutrientes e um método baseado apenas na topologia da rede para realizar análise de nutrientes através da enumeração de conjuntos minimais de precursores ausentes, que são suficientes para se produzir compostos essenciais definidos como alvo.

In this work we present an introduction to metabolic networks of organisms, its main biological concepts, different data structures that can be used to model these networks and a formal definition of three of the main problems related to nutrient analysis. Finally, this work presents a method based on the topology of the network to enumerate all the precursor sets of nutrients that are enough to synthetize some compounds defined as the targets of the network.