Banco de DNA barcodes: Representatividade das espécies de Ramalina (Ramalinaceae., Ascomycota liquenizados) que ocorrem no Brasil

Abstract

Os liquens, associações simbióticas entre fungos (micobiontes) e algas ou cianobactérias (fotobiontes), apresentam ampla distribuição geográfica e são reconhecidos como bioindicadores ambientais. O gênero Ramalina (Ramalinaceae, Ascomycota) inclui cerca de 230 espécies que formam liquens fruticosos globalmente, sendo 29 delas registradas no Brasil, com maior concentração nas regiões Sudeste e Sul. Este trabalho investigou a representatividade das espécies de Ramalina do Brasil no banco de dados GenBank, especificamente da região ITS do DNA ribossomal, DNA barcode universal dos fungos. O levantamento identificou que apenas 41% das espécies registradas para o Brasil possuem sequências de ITS disponíveis no GenBank. Dessas, somente 28% possuem sequências de ITS produzidas a partir de espécimes coletados no Brasil, evidenciando uma lacuna significativa de representatividade. Os resultados indicaram que algumas espécies apresentam grande divergência entre sequências produzidas a partir de espécimes coletados no mesmo país e em países diferentes, indicando que entre as sequências homônimas (identificadas como a mesma espécie no GenBank), há provavelmente espécies diferentes.. Por exemplo, Ramalina celastri apresentou apenas 83,2% de identidade média (16,8% de divergência) entre sequências brasileiras e norte-americanas. Essa discrepância entre a espécie atribuída para o espécime e a identidade genética pode ser devida a erros de identificação, a presença de complexos de espécies, e até mesmo a existência de espécies crípticas (fenotipicamente indistinguíveis, porém evolutivamente independentes). Como conclusão, constatou-se uma representatividade insatisfatória de sequenciamentos de DNA barcodes de espécies do gênero Ramalina presentes no Brasil, o que praticamente inviabiliza o uso da técnica como ferramenta auxiliar para a identificação de espécimes brasileiros. Além disso, ficou claro que nem todos os dados registrados no GenBank correspondem, de fato, às espécies relatadas. Dessa forma, fica evidente a necessidade da criação de um banco de DNA barcodes local, feito com espécimes brasileiros identificados por especialistas, para que essas sequências sirvam de referência para não especialistas conseguirem identificar espécimes desse gênero por meio do DNA barcoding.